Jeśli dziś piątek to mamy odkrycie 3

O żadnym odkryciu nie będę dziś pisał. Zaczęło się w zeszłym roku tym samym tytułem więc rezerwuję go dla sprawy kolagenu z kości Tyranozaura.

Tym razem Nature opublikowało głos w sporze o wyniki analizy starej kości T. rexa, z której wyizolowano i stwierdzono metodami analitycznymi białko kolagen. Publikacja (1) zespołu pani Schweitzer wzbudziła wiele dyskusji. Cztery tygodnie temu Science pisało o kolejnym ataku na publikację. Tym razem przedstawiono wyniki otrzymane z próbek tyranozaura jako artefakty powstałe z bakteryjnego śluzu i krystalizujących soli żelaza (2).

W najnowszym Science Rex Dalton pisze o kolejnych wątpliwościach związanych z omawianymi badaniami . Dalton w jednym artykule zestawił dotychczasowe publikacje na ten temat(3 i zawarte przypisy). Przytacza także bardzo interesującą wypowiedź naukowca współpracującego z M. Schweitzer przy sekwencjonowaniu próbek kości. Otóż John Asara, szef laboratorium spektroskopii w Beth Israel Deaconess Medical Center w Bostonie, po kolejnej nieudanej próbie powtórzenia otrzymanych wyników, odmówił publikacji spektrum wyizolowanych białek, twierdząc, że wykorzystaliby je inni badacze do własnych publikacji (3).

Zarzut ze strony Pavla Pevtznera jest dość osobistym atakiem na zespół i ich wynik. Pevtzner w Science opublikował komentarz do pracy Asara i Schweitzer gdzie napisał:

"Wyobraźmy sobie małpę wciskającą losowe klawisze na maszynie do pisania i załóżmy, że dano małpie 100.000 prób napisania sześcioliterowego słowa. Można być zaskoczonym gdyby małpa za pierwszą próbą wpisała sześcioliterowe słowo ze słownika Webstera; rzeczywiście prawdopodobieństwo tego jest raczej niskie. Jednak, nikt nie byłby zaskoczony gdyby jakieś ze 100.000 słów byly by napisane poprawnie. Teraz wyobraźmy sobie chłopca obserwującego małpę, który odkrywa, że 7 ze 100.000 słów jest napisanych poprawnie. Chłopiec jest tak zaskoczony, że pisze tekst "Moja małpa potrafi pisać" i publikuje go w naukowym czasopiśmie. niektórzy naukowcy nie są przekonani i żądają, poza siedmioma poprawnymi, listy wszystkich wygenerowanych przez małpę słów. Chłopiec nie rozumie sensu żądania. W rzeczy samej, jeśli pozostałe słowa to śmieci, jaki sens pytać o nie." (4)

Zarzucił im "analfabetyzm" w statystycznej analizie otrzymanych danych. Co staje się jeszcze ciekawsze, gdy weźmie się pod uwagę, że Asara wycofał we wrześniu 2007 jedno z odkrytych białek, tłumacząc brakiem statystycznego znaczenia. Poza tym potwierdza, że pozostałe wyniki analizy dały sekwencje białka, które wykazuje największe podobieństwo do kolagenu kurczaka, a więc "potomka" wielkich gadów. (5)

Mary Schweitzer ogłosiła, że w listopadzie odbędzie spotkanie z wybranymi naukowcami by ustalić standardy dalszych publikacji tego typu (3). Czy to jest odwlekanie śmierci publikacji i kariery?

literatura:

1. Asara, J. M., Schweitzer, M. H., Freimark, L. M. & Phillips, M. Science 316, 280–285 (2007)
2. Kaye, T. G., Gaugler, G. & Sawlowicz, Z. PLoS ONE 3, 2808 (2008)
3. Dalton, R, Nature 454, 1035 (2008)
4. Pevzner, P. A., Kim, S. & Ng, J. Science (2008)
5. Asara, J. M. et al. Science 317, 1324–1325 (2007)