Pisałem na tych stronach już o ukończonych projektach sekwencjonowania genomów różnych organizmów. Pisałem także o nowych, ciekawych metodach sekwencjonowania. Ile z zsekwencjonowanych organizmów to rośliny? Można by podejrzewać, że postępy w zielonej biotechnologii oparte są na znajomości wielu roślinnych genomów. Otóż jak dotąd opublikowano zaledwie trzy lub cztery, jeśli liczyć glony Chlamydomonas.
Trwają prace nad kolejnymi projektami sekwencjonowania, lecz rośliny i badacze roślin przegrywają w zabiegach o finansowanie. Dodatkową trudnością jest rozmiar sekwencjonowanych genomów. Genom bakterii Escherichia coli jest malutki w porównaniu, to zaledwie 4,7 Mb, podczas gdy ludzki genom zawiera 3 miliardy par zasad (3000 Mb). Rozmiar oczywiście ma znaczenie, ale są też zadziwiające wyjątki np. Amoeba dubia olbrzym w świecie pełzaków - 1mm średnicy i 670 000 Mb w genomie.
Zamieszczam tabelkę z gatunkami roślin nad którymi trwają prace. Gwiazdką oznaczone są gatunki, których genomy zostały opublikowane. Niektóre z wymienionych gatunków mają tam zasłużone miejsce zwłaszcza z powodów agronomicznych np. pszenica czy ziemniak. Ale po co tasznik? Tasznik, ten popularny chwast, jest bardzo podobny nie tylko morfologią, ale także fizjologią do rzodkiewnika pospolitego (Arabidopsis thaliana). Wiele robi się także dla wiedzy o świecie, nie tylko pod kątem późniejszego wykorzystania.
|
Nazwa
popularna
|
Nazwa
łacińska
|
rozmiar
genomu
|
|
Widliczka
|
Selaginella
moellendorffii
|
88 Mb
|
|
Rzodkiewnik*
|
Arabidopsis thaliana
|
130 Mb
|
|
---
|
Arabidopsis lyrata
|
230 Mb
|
|
Tasznik
|
Capsella rubella
|
250 Mb
|
|
Brzoskwinia
|
Prunus persica
|
270 Mb
|
|
---
|
Brachypodium distachyon
|
355 Mb
|
|
Kakao
|
Theobroma cacao
|
420 Mb
|
|
Kroplik
|
Mimulus guttatus
|
430 Mb
|
|
Ryż*
|
Oryza sativa
|
430 Mb
|
|
Lotus
|
Lotus japonicus
|
450 Mb
|
|
Topola*
|
Populus trichocarpa
|
480 Mb
|
|
Winorośl
|
Vitis vinifera
|
500 Mb
|
|
Lucerna
|
Medicago truncatula
|
550 Mb
|
|
Rzepak
|
Brassica napus
|
550 Mb
|
|
Fasola
|
Phaseolus vulgaris
|
630 Mb
|
|
Sorgo
|
Sorgum bicolor
|
736 Mb
|
|
Kassawa
|
Manihot esculenta
|
760 Mb
|
|
Ziemniak
|
Solanum tuberosum
|
840 Mb
|
|
Pomidor
|
Solanum lycopersicum
|
950 Mb
|
|
Soja
|
Glycine max
|
1115 Mb
|
|
Kukurydza
|
Zea mays
|
2600 Mb
|
|
Jęczmień
|
Hordeum vulgare
|
5000 Mb
|
|
Żyto
|
Secale cereale
|
9100 Mb
|
|
Owies
|
Avena sativa
|
11300 Mb
|
|
Pszenica
|
Triticum aestivum
|
16000 Mb
|
P.S. Rośliny nie są nudne. Na pewno nie nudniejsze niż mucha owocówka. :)
"Nauka jest jak seks. Są tego praktyczne skutki, ale nie dlatego to robimy"
Licznik działa od 27.04.07 i naliczył już wizyt.
można do mnie napisać
bromek.etydyny(rolmops)gmail.com
Nowości od blogera
Inne tematy w dziale Kultura
